- Это полипептиды. Входящие в их состав аминокислоты отличаются по заряду и гидрофобности. 0,5 балла
1) RGHFYDWMVQCINPSTWCAAQY
2) SYSMEHFRWGKPVGKKRRPVKVYPNGAEDESAEAFPLEF АКТГ
3) CYIQNCPLG окситоцин
4) RKKHRHRKНRKKHRRHHHKRHRRHHRKKKRKHHHRKR
5) ALLWVWAPFPMAWWPMLPAMWPMMLAAFVWAVPFWA
6) DERKHDEEDKH
7) EHGRDEDPGHKRHWAFPMAWWVPALPPFFLALWPPMLW
2 и 3 – пептидные гормоны АКТГ и окситоцин. В принципе 1 тоже может существовать в природе, на самом деле это случайный набор а.к. 4 – заряжен полностью положительно (в состав входят положительно заряженные а.к.), вероятно, по отдельности такой пептид существовать не может, но может входить в состав большого белка как положительно заряженный домен. 5 – в состав входят только гидрофобные а.к, то же, что и 4. 6 – наверное, может существовать и отдельно. 7 – на одном конце сосредоточены заряженные и полярные а.к. остатки, на другом – гидрофобные. По-видимому, тоже отдельно не существует, т.к. будет иметь склонность к образованию мицелл в водном растворе. 1 балл
- Полипептиды будут стремиться образовать статистический клубок. Вещество 5 будет растворяться очень трудно. Вещество 4 не будет сворачиваться в клубок, т.к. будут сильны силы отталкивания. 7 – может образовывать мицеллы. 1 балл
- Наименьшие размеры в воде будет иметь вещество 5, т.к. свернется в более компактный клубок из-за гидрофобных сил, наибольшие – вещество 4, из-за электростатического отталкивания. 2 балла
- С увеличением температуры вследствие увеличения хаотического движения мономеров в цепи размеры клубка будут увеличиваться. При снижении – в принципе возможен переход из состояния клубка в состояние плотной глобулы, в которой играют роль взаимодействия между отдельными звеньями цепи, т.е. размеры должны уменьшиться. Но данные пептиды имеют небольшие линейные размеры, поэтому эффект будет не так выражен. 1 балл
- Приблизительно можно использовать формулу для оценки размеров статистического клубка
, где N – число звеньев, l – длина одного звена. Длину одной пептидной связи в пептиде можно принять за 0.2 нм (в альфа-спирали по справочным данным длина одной пептидной связи 0.15 нм). 2 балла Однако, здесь в формулу расчета размеров клубка не включены значения валентных углов, кроме того, она применима только для достаточно длинных цепей. 0,5 балла Для теоретического определения конформации пептидов в растворе могут быть использованы методы молекулярного моделирования, для экспериментального определения размеров метод динамического светорассеяния, электрофорез и другие методы 1 балл