Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными
разработка методов выявления точечных мутаций в ДНК, в том числе с использованием ДНК-зависимых ферментов
разработка тест-систем для анализа полиморфных участков нуклеиновых кислот
термодинамическое описание образования комплексов нуклеиновых кислот
Пышный Дмитрий Владимирович, заведующий лабораторией, кандидат наук
Описание
Зав. лабораторией Пышный Дмитрий Владимирович, кандидат химических наук, доцент, зам. директора по научной работе Новосибирскиого института биоорганической химии СО РАН. Лауреат VII конкурса молодых ученых Европейской Академии наук (1999 г), лауреат премий журнала «Биоорганическая химия» (1997 и 1998 гг), лауреат премии издательства МАИК «Наука» (1998 г)
Основные научные результаты
Систематически изучены физико-химические особенности образования тандемных олигонуклеотидных комплексов с ДНК.
исследованы особенности ферментативного лигирования олигонуклеотидов на ДНК матрице в зависимости от нуклеотидной композиции в точке одноцепочечного разрыва ДНК
на основе метода лигирования коротких олигонуклеотидов (трехкомпонентных тандемов) разработан ряд тест-систем для диагностики известных полиморфных сайтов в анализируемой ДНК (Y-хромосома человека, фенилкетонурия (R408W), ген Pol ВИЧ-1, генотипирование ВГС)
систематически изучены физико-химические особенности образования ДНК-ДНК комплексов олигонуклеотидов, несущих ненуклеотидные вставки на основе олигометилендиолов и олигоэтиленгликолей (мостиковых олигонуклеотидов)
с использованием олигонуклеотидов зондов, несущих ненуклеотидные вставки, разработан высокоселективный подход к анализу точечных мутаций в ДНК
Основные направления исследований
Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными.
Термодинамическое описание образования комплексов нуклеиновых кислот, формируемых с участием: тандемов олигонуклеотидов; олигонуклеотидов, несущих остатки органических лигандов (интеркаляторов, лигандов малой бороздки, флуорофоров, ненуклеотидные вставки).
Разработка методов выявления точечных мутаций в ДНК, в том числе с использованием ДНК-зависимых ферментов (ДНК-лигаза, ДНК-полимераза).
Разработка тест-систем для анализа полиморфных участков нуклеиновых кислот.
Проекты и гранты
грант РФФИ (06-04-49263-а ) "«“Мостиковые” олигонуклеотиды – новые зонды с уникальными гибридизационными и ДНК-субстратными свойствами»
"
грант Программы Президиума РАН (10.6 ) "«Исследование фундаментальных аспектов ДНК-диагностики и действия ген-направленных биологически активных веществ: гибридизация нуклеиновых кислот с олигонуклеотидами, их аналогами и производными». "
Грант для молодых ученых Министерства образования и науки РФ (ЗН-454-04) "«Одноцепочечный разрыв в ДНК: взаимосвязь термодинамических характеристик коаксиального стэкинга пар оснований в ДНК и эффективности ферментативого лигирования». "
Наиболее значимые публикации
Abramova, T.V., Kassakin, M.F., Lomzov, A.A., Pyshnyi, D.V., Silnikov, V.N. , "New oligonucleotide analogues based on morpholine subunits joined by oxalyl diamide tether " // Bioorganic Chemistry , 2007, 35 (3), 258 - 275
Cherepanova, A., Tamkovich, S., Pyshnyi, D., Kharkova, M., Vlassov, V., Laktionov, P. , "Immunochemical assay for deoxyribonuclease activity in body fluids " // Journal of Immunological Methods , 2007, 325 (1-2), 96 - 103
Mal'shakova, V.S., Laktionov, P.P., Pyshnyi, D.V., Vlasov, V.V. , "Intracellular localization of natural and modified oligonucleotides in primary human endothelial cells " // Bulletin of Experimental Biology and Medicine , 2007, 143 (2), 204 - 206
Vinogradova, O.A., Pyshnaya, I.A., Zarytova, V.F., Ivanova, E.M., Pyshnyi, D.V. , "Enhancement of a hybridization analysis efficiency by the controlled DNA fragmentation " // Molecular Biology , 2007, 41 (1), 148 - 156
Lomzov A.A., Pyshnaya I.A., Ivanova E.M.. , "Hybridization of the bridged oligonucleotides with DNA: thermodynamic and kinetic studies. " // J. Biomol. Struct. Dyn, 2006 (23), 567 - 580
Mironova N.L., Pyshnyi D.V., Ivanova E.M., Zenkova M.A., Gross H.J., Vlassov V.V. , "Covalently attached oligodeoxyribonucleotides induce RNase activity of a short peptide and modulate its base specificity" // Nucleic Acids Res., 2004, 32 (6), 1928 - 1936
Pyshnyi D.V., Goldberg E.L., Ivanova E.M. , "Efficiency of coaxial stacking depends on the DNA duplex structure" // J. Biomol. Struct. Dyn., 2003, 21 (3), 459 - 468
Пышный Д.В., Кривенко А.А., Лохов С.Г., Иванова Е.М., Дымшиц Г.М., Зарытова В.Ф. , "Взаимодействие производных коротких олигонуклеотидов с нуклеиновыми кислотами VI. Дискриминация комплексов с мисматчем при лигировании тандема коротких олигонуклеотидов" // Биоорган. химия, 1998, 24 (1), 32 - 37
В эпоху коронавируса и борьбы с ним в существенной степени меняется парадигма выполнения творческих работ и ведения бизнеса, в той или иной мере касаясь привлечения новых типов дистанционного взаимодействия, использования виртуальной реальности и элементов искусственного интеллекта, продвинутого сетевого маркетинга, использования современных информационных технологий и инновационных подходов. В этих условиях важным является, насколько само общество готово к использованию этих новых технологий и как оно их воспринимает. Данной проблеме и посвящен этот небольшой опрос, мы будет рады, если Вы уделите ему пару минут и ответите на наши вопросы.
Небольшой опрос о том, как изменились подходы современного предпринимательства в контексте новых и возникающих форм ведения бизнеса, онлайн образования, дистанционных форм взаимодействия и коворкинга в эпоху пандемии COVID - 19.
Технопредпринимательство - идея, которая принесет свои плоды при бережном культивировании и взращивании. И наша наноолимпиада, и Наноград от Школьной Лиги РОСНАНО, и проект Стемфорд, и другие замечательные инициативы - важные шаги на пути реализации этой и других идей, связанных с развитием новых высоких технологий в нашей стране и привлечением молодых талантов в эту вполне стратегическую область. Ниже приведен небольшой опрос, который позволит и нам, и вам понять, а что все же значит этот модный термин, и какова его суть.
Сайт создан в 2006 году совместными усилиями группы сотрудников и выпускников ФНМ МГУ.
Сайт модернизирован для ресурсной поддержки проектной деятельности учащихся
в рамках ГК 16.647.12.2059 (МОН РФ)
Частичное или полное копирование материалов сайта возможно. Но прежде чем это делать ознакомьтесь с инструкцией.
